Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx3P81067 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx3P81067 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx3P81067 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx3P81067 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx3P81067 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx3P81067 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx3P81067 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx3P81067 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx3P81067 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx3P81067 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Irx3P81067 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx3P81067 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms