Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms