Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Hoxd13P70217 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Hoxd13P70217 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Hoxd13P70217 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd13P70217 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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