Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf5P70191 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf5P70191 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf5P70191 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf5P70191 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf5P70191 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf5P70191 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf5P70191 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf5P70191 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf5P70191 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms