Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CgnP59242 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CgnP59242 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CgnP59242 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CgnP59242 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CgnP59242 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CgnP59242 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CgnP59242 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CgnP59242 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CgnP59242 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CgnP59242 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CgnP59242 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CgnP59242 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CgnP59242 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CgnP59242 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CgnP59242 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CgnP59242 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CgnP59242 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CgnP59242 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CgnP59242 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CgnP59242 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CgnP59242 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CgnP59242 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CgnP59242 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CgnP59242 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CgnP59242 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CgnP59242 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CgnP59242 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CgnP59242 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CgnP59242 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CgnP59242 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CgnP59242 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CgnP59242 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CgnP59242 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CgnP59242 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CgnP59242 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CgnP59242 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CgnP59242 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CgnP59242 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CgnP59242 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CgnP59242 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CgnP59242 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CgnP59242 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CgnP59242 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CgnP59242 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CgnP59242 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CgnP59242 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CgnP59242 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CgnP59242 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CgnP59242 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CgnP59242 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CgnP59242 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CgnP59242 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CgnP59242 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CgnP59242 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CgnP59242 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CgnP59242 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CgnP59242 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CgnP59242 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CgnP59242 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CgnP59242 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CgnP59242 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CgnP59242 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CgnP59242 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CgnP59242 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CgnP59242 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CgnP59242 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CgnP59242 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CgnP59242 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CgnP59242 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CgnP59242 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CgnP59242 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CgnP59242 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CgnP59242 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CgnP59242 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CgnP59242 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CgnP59242 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CgnP59242 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CgnP59242 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CgnP59242 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CgnP59242 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CgnP59242 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CgnP59242 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CgnP59242 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CgnP59242 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CgnP59242 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CgnP59242 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CgnP59242 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CgnP59242 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CgnP59242 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CgnP59242 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CgnP59242 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CgnP59242 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CgnP59242 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CgnP59242 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CgnP59242 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CgnP59242 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CgnP59242 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CgnP59242 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CgnP59242 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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