Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms