Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Sh3bp1P55194 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Sh3bp1P55194 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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Sh3bp1P55194 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Sh3bp1P55194 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Sh3bp1P55194 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Sh3bp1P55194 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms