Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb41P48193 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb41P48193 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb41P48193 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb41P48193 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms