Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Sdc2P43407 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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