Protein–RNA interactions for Protein: P35441

Thbs1, Thrombospondin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs1P35441 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Thbs1P35441 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Thbs1P35441 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Thbs1P35441 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Thbs1P35441 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Thbs1P35441 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Thbs1P35441 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Thbs1P35441 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Thbs1P35441 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Thbs1P35441 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs1P35441 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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