Protein–RNA interactions for Protein: P30658

Cbx2, Chromobox protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx2P30658 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx2P30658 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx2P30658 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx2P30658 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx2P30658 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx2P30658 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx2P30658 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx2P30658 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx2P30658 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx2P30658 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx2P30658 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx2P30658 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx2P30658 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx2P30658 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx2P30658 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx2P30658 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx2P30658 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx2P30658 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx2P30658 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx2P30658 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx2P30658 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx2P30658 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx2P30658 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx2P30658 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx2P30658 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx2P30658 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx2P30658 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx2P30658 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx2P30658 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms