Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms