Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa2P28309 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa2P28309 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa2P28309 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa2P28309 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms