Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpraP18052 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpraP18052 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpraP18052 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpraP18052 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PtpraP18052 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpraP18052 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PtpraP18052 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PtpraP18052 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PtpraP18052 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpraP18052 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpraP18052 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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