Protein–RNA interactions for Protein: P01724

Ig lambda-1 chain V regions MOPC 104E/RPC20/J558/S104, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01724 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01724 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01724 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01724 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01724 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P01724 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01724 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01724 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01724 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01724 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01724 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01724 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01724 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01724 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01724 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01724 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01724 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P01724 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01724 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01724 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01724 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01724 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01724 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01724 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01724 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01724 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P01724 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P01724 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01724 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P01724 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01724 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01724 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01724 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01724 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01724 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01724 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01724 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01724 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01724 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01724 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01724 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01724 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01724 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01724 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01724 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01724 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01724 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01724 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01724 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01724 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01724 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01724 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01724 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01724 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01724 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01724 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01724 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01724 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01724 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01724 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01724 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01724 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01724 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01724 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01724 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01724 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01724 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01724 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01724 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01724 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01724 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01724 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01724 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01724 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01724 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01724 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01724 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01724 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P01724 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01724 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01724 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01724 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01724 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01724 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01724 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01724 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01724 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01724 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01724 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01724 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01724 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01724 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01724 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01724 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01724 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01724 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01724 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01724 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01724 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01724 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms