Protein–RNA interactions for Protein: O88696

Clpp, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClppO88696 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ClppO88696 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ClppO88696 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ClppO88696 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ClppO88696 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ClppO88696 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ClppO88696 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
ClppO88696 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
ClppO88696 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
ClppO88696 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ClppO88696 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ClppO88696 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ClppO88696 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ClppO88696 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ClppO88696 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ClppO88696 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ClppO88696 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ClppO88696 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ClppO88696 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ClppO88696 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ClppO88696 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ClppO88696 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ClppO88696 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ClppO88696 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ClppO88696 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ClppO88696 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ClppO88696 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ClppO88696 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ClppO88696 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ClppO88696 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ClppO88696 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ClppO88696 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ClppO88696 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ClppO88696 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ClppO88696 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ClppO88696 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ClppO88696 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ClppO88696 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ClppO88696 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ClppO88696 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ClppO88696 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ClppO88696 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ClppO88696 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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ClppO88696 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ClppO88696 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ClppO88696 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ClppO88696 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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ClppO88696 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ClppO88696 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ClppO88696 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ClppO88696 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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ClppO88696 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ClppO88696 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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ClppO88696 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ClppO88696 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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ClppO88696 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ClppO88696 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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ClppO88696 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ClppO88696 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ClppO88696 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ClppO88696 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ClppO88696 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ClppO88696 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ClppO88696 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ClppO88696 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ClppO88696 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ClppO88696 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ClppO88696 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ClppO88696 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ClppO88696 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ClppO88696 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ClppO88696 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ClppO88696 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ClppO88696 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ClppO88696 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ClppO88696 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ClppO88696 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ClppO88696 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ClppO88696 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ClppO88696 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ClppO88696 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ClppO88696 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ClppO88696 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ClppO88696 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ClppO88696 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ClppO88696 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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