Protein–RNA interactions for Protein: O54946

Dnajb6, DnaJ homolog subfamily B member 6, mousemouse

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Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb6O54946 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Dnajb6O54946 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Dnajb6O54946 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Dnajb6O54946 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Dnajb6O54946 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Dnajb6O54946 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Dnajb6O54946 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Dnajb6O54946 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Dnajb6O54946 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Dnajb6O54946 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Dnajb6O54946 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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Dnajb6O54946 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms