Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Sp100O35892 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sp100O35892 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sp100O35892 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sp100O35892 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Sp100O35892 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sp100O35892 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Sp100O35892 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Sp100O35892 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Sp100O35892 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sp100O35892 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sp100O35892 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sp100O35892 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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