Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx1aO35526 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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