Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hps1O08983 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hps1O08983 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hps1O08983 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hps1O08983 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hps1O08983 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hps1O08983 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hps1O08983 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hps1O08983 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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