Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
MsmbO08540 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MsmbO08540 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
MsmbO08540 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
MsmbO08540 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MsmbO08540 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
MsmbO08540 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
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