Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms