Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccer2J3QPU5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms