Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm2035J3QP87 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm2035J3QP87 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm2035J3QP87 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms