Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9S8

Gm2564, C-C motif chemokine, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2564F6Z9S8 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Gm2564F6Z9S8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Gm2564F6Z9S8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Gm2564F6Z9S8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Gm2564F6Z9S8 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Gm2564F6Z9S8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Gm2564F6Z9S8 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Gm2564F6Z9S8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Gm2564F6Z9S8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Gm2564F6Z9S8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Gm2564F6Z9S8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2564F6Z9S8 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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