Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Itga10-201ENSMUST00000029744 5044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Dclk1-203ENSMUST00000167204 6025 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Phf20-201ENSMUST00000037401 5737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Slc45a3-202ENSMUST00000177943 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Fyco1-201ENSMUST00000084715 7949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Ctnnd1-218ENSMUST00000111692 6170 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Nek10-206ENSMUST00000224491 9567 ntAPPRIS P2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Gm26574-201ENSMUST00000181876 2141 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Gm9866-203ENSMUST00000182592 8487 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Stat1-205ENSMUST00000186574 2834 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Gm45847-201ENSMUST00000209402 1880 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Synpo2-203ENSMUST00000106427 6937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Clic5-201ENSMUST00000024755 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Npas4-201ENSMUST00000056129 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 A630009H07Rik-201ENSMUST00000208485 2159 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Myo16-202ENSMUST00000207204 6719 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 4930470B04Rik-201ENSMUST00000192005 1926 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Cacna1c-206ENSMUST00000185345 6579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Gm10531-201ENSMUST00000193527 2303 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms