Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ8

E430018J23Rik, RIKEN cDNA E430018J23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E430018J23RikE9PZQ8 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms