Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms