Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim30bE9PVL6 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim30bE9PVL6 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim30bE9PVL6 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim30bE9PVL6 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim30bE9PVL6 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim30bE9PVL6 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim30bE9PVL6 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim30bE9PVL6 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim30bE9PVL6 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim30bE9PVL6 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim30bE9PVL6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim30bE9PVL6 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim30bE9PVL6 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim30bE9PVL6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim30bE9PVL6 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim30bE9PVL6 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim30bE9PVL6 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim30bE9PVL6 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim30bE9PVL6 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim30bE9PVL6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim30bE9PVL6 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim30bE9PVL6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim30bE9PVL6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim30bE9PVL6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim30bE9PVL6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30bE9PVL6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30bE9PVL6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30bE9PVL6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30bE9PVL6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30bE9PVL6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30bE9PVL6 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30bE9PVL6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30bE9PVL6 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30bE9PVL6 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30bE9PVL6 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30bE9PVL6 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30bE9PVL6 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30bE9PVL6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30bE9PVL6 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30bE9PVL6 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms