Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms