Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd1D3YXK1 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms