Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AU015836B2RUM3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms