Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms