Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms