Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF7

Plcb2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plcb2A3KGF7 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plcb2A3KGF7 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms