Protein–RNA interactions for Protein: A2BI93

Ssxb9, Synovial sarcoma, X member B9, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb9A2BI93 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb9A2BI93 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb9A2BI93 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb9A2BI93 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb9A2BI93 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms