Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F4

Cib1, Calcium and integrin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib1Q9Z0F4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cib1Q9Z0F4 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cib1Q9Z0F4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cib1Q9Z0F4 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cib1Q9Z0F4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cib1Q9Z0F4 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cib1Q9Z0F4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cib1Q9Z0F4 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cib1Q9Z0F4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cib1Q9Z0F4 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cib1Q9Z0F4 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cib1Q9Z0F4 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cib1Q9Z0F4 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cib1Q9Z0F4 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cib1Q9Z0F4 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cib1Q9Z0F4 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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