Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms