Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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