Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS5

Sv2a, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2aQ9JIS5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sv2aQ9JIS5 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms