Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
OtofQ9ESF1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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