Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms