Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms