Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Smg9Q9DB90 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Smg9Q9DB90 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Smg9Q9DB90 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Smg9Q9DB90 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Smg9Q9DB90 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Smg9Q9DB90 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Smg9Q9DB90 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg9Q9DB90 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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