Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn9Q9D805 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms