Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Chmp4cQ9D7F7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chmp4cQ9D7F7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chmp4cQ9D7F7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chmp4cQ9D7F7 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chmp4cQ9D7F7 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chmp4cQ9D7F7 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chmp4cQ9D7F7 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chmp4cQ9D7F7 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chmp4cQ9D7F7 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chmp4cQ9D7F7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chmp4cQ9D7F7 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chmp4cQ9D7F7 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chmp4cQ9D7F7 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chmp4cQ9D7F7 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chmp4cQ9D7F7 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chmp4cQ9D7F7 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chmp4cQ9D7F7 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chmp4cQ9D7F7 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chmp4cQ9D7F7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chmp4cQ9D7F7 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chmp4cQ9D7F7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chmp4cQ9D7F7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chmp4cQ9D7F7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chmp4cQ9D7F7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chmp4cQ9D7F7 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms