Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Borcs6Q9D6W8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Borcs6Q9D6W8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
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Borcs6Q9D6W8 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Borcs6Q9D6W8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Borcs6Q9D6W8 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Borcs6Q9D6W8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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