Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms