Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt34Q9D646 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt34Q9D646 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt34Q9D646 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt34Q9D646 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt34Q9D646 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt34Q9D646 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt34Q9D646 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt34Q9D646 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt34Q9D646 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt34Q9D646 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt34Q9D646 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt34Q9D646 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt34Q9D646 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Krt34Q9D646 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt34Q9D646 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Krt34Q9D646 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt34Q9D646 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt34Q9D646 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt34Q9D646 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt34Q9D646 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt34Q9D646 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt34Q9D646 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt34Q9D646 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Krt34Q9D646 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt34Q9D646 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt34Q9D646 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt34Q9D646 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt34Q9D646 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt34Q9D646 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Krt34Q9D646 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt34Q9D646 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Krt34Q9D646 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Krt34Q9D646 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Krt34Q9D646 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Krt34Q9D646 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Krt34Q9D646 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt34Q9D646 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt34Q9D646 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Krt34Q9D646 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Krt34Q9D646 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Krt34Q9D646 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Krt34Q9D646 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt34Q9D646 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Krt34Q9D646 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt34Q9D646 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt34Q9D646 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt34Q9D646 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt34Q9D646 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt34Q9D646 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt34Q9D646 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt34Q9D646 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt34Q9D646 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt34Q9D646 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt34Q9D646 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt34Q9D646 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt34Q9D646 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt34Q9D646 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt34Q9D646 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt34Q9D646 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt34Q9D646 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms