Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms